痂囊腔菌属PKS基因特性分析.docx
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1、Characterizationofpo1.ykctidcsynthasegenesfromE1.sinoespp.和囊腔MPKS嘱因特性分析目的:得到花生疮痂病的的PKS域因,明确其PKS的结构域,证明由素的合成受到PKS的网控.方法:I使用简并引物对其胡君合iKS保守区进行扩增,通过染色体步格,泅得其全长.2对荻得的全长翻译后进行宽基酸的进化树分析.确定其种类3对基因表达进行研究讨论:Materia1.andmethodsFunga1.strainsandgrowthconditions尾胞(Genebanktiff).柑橘(Genebimk己有,他葡,花生Iso1.ationofthek
2、etovnthase(KS)domainusingdegenerateprimers采用简并引物扩增PKS的KS保守区域.步骤方法Identificationofpartia1.PKSsequencesKS保守区域熨基取序列对比(尾他.柑橘.匍葡,花生.黄曲褥毒索,爆刀菌素)Genomewa1.king获得权因全长,标记各个PKS域分布及与其他相似的比较SAPKSPhy1.ogeneticana1.ysisofPKSsequences进化树选择不同类型的PKS基因类型1.2.3),选择还原鞭及非还原型.(参考2003)选择还原型和非还原型两种.Expressionana1.ysesofPKSg
3、enes测定各个域的表达量及整个基因的衣达量,明确该基因的表达是否与光照有相关性,或者存在其他相关联基因共同调节次生代谢产物.SAPKSEkafage1.gsigtssr1.vtayea1.eesgyvpnrtpstk1.iirigtfygqtsddwreinaaenVdtyfitggvrafakirixyyfkfsgpsfsv,Baaiqi.actsi.wagkdtacagg1.nv1.tnpdifsg1.skgqf1.sktgscktydndadgycrgdgcgsvi1.kryedaiadkdni1.Gci1.gaatnhsaeavsitiiphagaqef1.fkkv1.adagida
4、hqidyvemhgtgtiii (E1.sinocIawocttiiMsnv1.1.1.gdqtadqsp1.1.rk1.v1.rrnda1.vttfheqvsva1.rdevsk1.parqrqdipsf1.k1.n1.vd1.yyQGDKRI.Pi1.estfvaitq1.ghyigyfsenpdr1.pyaantrv1.g1.ctgs1.aatvivsaksise1.vs1.veVriafragacvdaakrv1.qqpgeekepwstivmn1.sekdaqka1.defhsstgtsgpsrayIsaistmavtIsgppsttqk1.fseszxd1.stknrvsipiy
5、apyhaah1.hserd1.qriipdssra1.1.kkyqpht1.1.hssagEC1.VADNTCD1.MSI.AI.VDFI.REPVRWDRM.EESISQ11ATPKAPAKIFTIGVSNVANSMAAA1.KSGQATVsitdhtswivpddynstrgrtqndkiaivgmsgrfpsaasvda1.we1.1.ekg1.dvhrkipaDrfdadahcDpsgksknkshtpygcfidepg1.fdprffnmspreazxqtdpmgr1.a1.vtayezx1.eesgyvpnrtpstk1.hR1.GTFYGQrSDDwREINAAENVDrYFr
6、rGGVRAFAPGRINYYFKFSGPSES1.HHaAiq1.acts1.WGDCDTACAGG1.NV1.TNPDISG1.SKGQ1.SKTGSCKTYDNDADGYCRGDGCGSVI1.KRyedaiadkdnI1.GCI1.GAATNHSAEAVSrrHPHAGNQEF1.FKKV1.AEAGVDAHE1.SYVEMHGTGTQAGDG1.EMTSVTNAFAppnrrrtpdek1.f1.gaikanvgiigeaasgins1.akv1.mmfkknaipanvgikgvmnesfpkd1.gernvhIP1.KQVEFPRNGDAPRK1.F1.NNFSAAGGNTS1.
7、1.1.EDGPVRKPSTVKDPRST1.PITvTARS1.AS1.KRNIDN1.ksyi-Sktpeasits1.sytstarriqhnyriafpatdinkvsea1.daqikdsyspvaitatrvaFCFTGQGsqytg1.gqk1.yqd1.psfkadidq1.nq1.aeshn1.psf1.e1.fdgtdvat1.spvkvq1.gtaciQva1.srmweSwgikpsavighs1.geyaa1.hvagvisasdmvy1.vgrrzxe1.1.vkdctphthgm1.avkasvDairna1.gskMrEMacingpeetv1.cgsseivt
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