乙型肝炎病毒相关性原发性肝癌患者前X基因的分子流行病学意义.docx
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1、乙型肝炎病毒相关性原发性肝癌患者前X基因的分子流行病学意义乙型肝炎病毒相关性原发性肝癌患者前X基因的分f流行病学意义乙型肝炎病毒相关性原发性肝癌患者前K基因的分子流行病学意义【摘要】目的:了解前X基因在HBV相关HCC患者中的流行病学分布、前X基因和HBV基因型与HCC的临床关系.方法:患有乙肝的肝细胞肝癌患者35例,采纳型特异性引物巢式聚合醐链反应进行基因分型.同时对明确基因分型的肝癌患者,扩增前X区,TA克隆到PMD18T载体后进行单克隆测序,分析前X区在肝癌患者的表达状况,对前海X区和基因型及相关病情进行探讨.结果三:HCC患者35例中B基因型1例,C基因型24例,B/C混合基因型8例,
2、在未定型者2例.明确基因型的患者33例琶,进一步扩增前X区,并经TA克隆获杳得93个单克隆株中,经测序表明,有6哧5个单克隆株编码前X多肽,占之H觞CC患者33例中有29例编码前X多海肽,编码率为乐高于慢性乙型肝炎患者孜治的编码率.C基因型前X多肽编码率铲为先,B/C混合型编码率为乐B基因洲型无编码.前X区的发达与年龄,性别敝,家族史,AFP,HBVDNA,A1.疤T水平间无关.结论:HCC患者中C基因型、B/C混合基因型较为多见.前X之间有确定相关性.【关键词】肝炎病毒乙型基因豚型前X基因癌肝细胞。引言乙型影肝炎病毒在其负链上含4个部分重登的开榻放读码框架即前S/S区、前C/C区、P区和X区
3、,分别编码7种性质不同的蛋慢白如HBcAg,HBeg.HBsAg等.有探讨表明,X区编码的HBXAg与肝细胞肝癌的形成亲密相关门.荡探讨证明,在XORF的上游还存在一个磔新的ORF即前XoRF2,而关于其的功能探讨尚不多见,是否具有类似族功能尚不确定,我们对前XORF功能三进行初步探讨.1对象和方法对象X战X01/XX12HBVDNA阳性乙的HCC患者35例.全部患者均经B超岫、CT和核磁共振或血管造影等临床诊断励为乙肝相关性肝癌,采纳蛋白酶K、酚饰氯仿异戊醇法提取血清HBVDNA.乙肝标记物(HBVM:HBsAg,研AntiHBs,HBeAg,Ant签iHBe,AntiHBc)的测定觎均采纳
4、E1.ISA法检测,试剂由华美生物工程有限公司供应.生化指标由我院全T自动生化检测仪常规测定.方法通过比对不同HBV基因型序列以及参考Nat魔io3等设计的6种主要基因型的分渥析方法,设计了共同的外引物P1.P2免,进行PCR扩增,并以扩增产物为模板沦进行基因型特异性内引物扩增.基因型特异性内引物犷增分为A,B两组,其中捆A组包括共有的上游引物P3,PA,PTB,PC(基因型C特异性下游引物),攸B组包括上游引物P4以及基因型D,E脓,F的特异性下游引物PD,PE,PF淫,同时行PCR扩增.取第2轮PCR扩腆增产物51.经过20g1.琼脂糖凝胶电泳后推断HBV基因型,依据电泳结果洼推断HBV基
5、因型.以35例HCC患街者中明确HBV基因分型的33例患者H管BVDNA溶液为模板,依据前X上游滞引物Px1.,下游引物为Px2,扩增前冰X区4.Px1.下游第3133陆nt处为前X区起始密码子ATG,P轻x2上游3032n1.处为X区起始密码子ATG,扩增的靶区域全长231n岐t,其中前X区全长为168n1.将澄PCR产物回收并连接至PMD18T舐载体,将连接好的重组体转入感受态细胞焙,经第羊青霉素和Xga1.蓝臼斑法初垂步筛选阳性菌落,进一步提取质粒采纳PCR法鉴定.对经过鉴定的胜利导入前呆X基因的菌落送测序.统计学处理:所有数据应用统计软件分析,不同组间率的格比较采纳2检验,均数比较采纳
6、t检验P2结果基因型应用该基因型分型方窥法,A组PCR产物电泳时基因型为6从8bp,B基因型为281bp,C基因缁型为122bp;B组电泳时D基因型为H9bp,E基因型为167bp,F拿基因型为67bp.本组的35例患者中橐,B基因型1例,C基因型24例,B/迳C混合基因型8例,未定型者2伊人未见龄其他基因型.前X基因PCR扩增扩增的靶区域全长231bp,胜利构建战出PMD18T前X载体后,以P银MD18T载体上游引物M13和PX争1为上游引物、Px2为共有的下游引物同时行PCR扩增,可得到308bp和锄231bp的片断,说明克隆胜利.前X基因序列分析经鉴定胜利导入重组体琳的菌落,随机共选取9
7、3株送测序.前桔XORF全长168bp,位于测序片断泊的第31位至第198位,依据其测序结师果推定核甘酸序列如下:TGGGGCnGGCTATTGGCCATCGHCCGCATGCGTGGAACCTT秦TGTGGctcctctgccgaTccatactgcggaactcc标TAGCAGCTTGTTTTGC榇cgcgccggtctggagcg#actttcggaccgc扪ctctgttGtcctctc盹Tcggaaatacacctcctt莓TCc:在这93个克隆中有65个克惹隆在第333bp处为ATG,而该款位点即为前X基因的起始位点,是胜利卡编码前X多肽的关键所在,占所测核甘酸序列的爷.而经过进一
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